2020年4月7日 星期二

PyTorch register_buffer


通常我們想要建立一個 tensor 時,會用以下方法:

a = torch.tensor(0.1)

假如要在一個 module 中建立一些 tensor,可能會使用如下方法:

class Layer(nn.Module):
    self.__init__(self, num_outputs, num_inputs):
        self.w = nn.Parameter(torch.Tensor(num_outputs, num_inputs))
        self.a = torch.tensor(0.1)

其中的 w 是可以被訓練的參數,而 a 是無法被訓練的。

這時我們會遇到一個問題,當我們想要將整個 module 從 CPU 移動到 GPU 時:

layer = Layer(10, 100)
layer = layer.to('cuda:0')

我們會發現 w 可以成功的移動,但是 a 卻仍然停留在 CPU 上。其中的差異就在,nn.Parameter 會將 w 宣告成一個 module 內的參數,但是用一般 torch.tensor 方法宣告的卻不會。

那麼假如我們想要在 module 內建立一個不可訓練的參數要怎麼做呢?答案是:使用 register_buffer 功能。

以上面的例子來說,a 可以改用以下方式宣告:

self.__init__(self):
    self.register_buffer('a', torch.tensor(0.1))

之後我們要使用 a 時,一樣用 self.a 就可以使用了。如此一來,當我們將 module 移動到 GPU 時,a 也會跟著一起移動。

2020年3月30日 星期一

PyTorch 特殊函數之求導

torch.max() / torch.min()

對 torch.max() 進行 backward() 時,對輸入的 tensor 中數值最大的元素的 gradient 會貢獻 1,其餘則為 0。

對 torch.min() 進行 backward() 時,對數值最小的元素的 gradient 會貢獻 1,其餘則為 0。

程式
a = torch.tensor([1., 2., 3.], requires_grad=True)
b = torch.max(a)
b.backward()
a.grad

輸出
tensor([0., 0., 1.])

torch.abs()

對 torch.abs() 進行求導時,對輸入的 tensor 中正的元素的 gradient 貢獻為 1,對負的元素的 gradient 貢獻為 -1,對元素值為 0 的 gradient 貢獻為 0。

程式
a = torch.tensor([-1., -2., 3., 0.], requires_grad=True)
b = torch.abs(a)
b.backward(torch.ones_like(b))
a.grad

輸出
tensor([-1., -1., 1., 0.])

torch.where()

d = torch.where(a, b, c)
a 通常是一個 bool type 的張量,在 a 張量裡面是 True 的位置,b 該位置的元素值會傳到 d 的相應位置,在 a 張量裡面是 False 的位置,c 該位置的元素值會傳到 d 的相應位置。當我們對 where 進行 backward 時,在 b 和 c 當中有傳到 d 的那些位置的 grad 是 1,其餘位置的 grad 是 0。

程式
a = torch.tensor([True, False, False, True, True])
b = torch.tensor([1., 2., 3., 4., 5.], requires_grad=True)
c = torch.tensor([2., 4., 6., 8., 10.], requires_grad=True)
d = torch.where(a, b, c)
d
d.backward(torch.ones_like(d))
b.grad
c.grad

輸出
tensor([1., 4., 6., 4., 5.], grad_fn=<SWhereBackward>)   # d
tensor([1., 0., 0., 1., 1.])   # b.grad
tensor([0., 1., 1., 0., 0.])   # c.grad

求導結果為 0 的函數

sign, ceil

不可求導的函數

argmax, argmin, lt, le, eq, ne, ge, gt

當一條運算路徑中有經過不可求導函數時,在進行 backward() 時,這條路徑就無法進行求導運算了。

PyTorch add function


在 PyTorch 中的 add function,可以實現將兩個張量相加,可以寫成 c = torch.add(a, b),也可以直接寫成 c = a + b。

其中 a 和 b 分別可以是一個張量加上一個純量,結果 c 就會是把純量加到張量中的每一個元素上。

a 和 b 也可以是兩個張量,但是若要實現兩個張量的相加,a 和 b 的 size 就有特定的限制 (broadcastable)。

以下幾種 a 和 b 的 size 是允許相加的:

Size of a:  (5)
Size of b:  (3, 2, 1, 5)

Size of a:  (1, 5)
Size of b:  (3, 2, 1, 5)

Size of a:  (2, 1, 5)
Size of b:  (3, 2, 1, 5)

Size of a:  (3, 2, 1, 5)
Size of b:  (3, 2, 1, 5)

由以上的例子可以看出,其中一個張量 (a) 的維度必須小於或等於另一個張量 (b),而且 a 的 size 必須與另一個張量 b 的最後幾個維度的 size 相同。

以下幾種 a 和 b 也是允許相加的:

Size of a:  (3, 2, 2, 5)
Size of b:  (1, 5)

Size of a:  (3, 2, 2, 5)
Size of b:  (1, 1, 5)

Size of a:  (3, 2, 2, 5)
Size of b:  (2, 1, 5)

Size of a:  (3, 2, 2, 5)
Size of b:  (3, 1, 1, 5)

Size of a:  (1, 5)
Size of b:  (2, 1)

Size of a:  (1, 1, 1, 5)
Size of b:  (1, 2, 1, 1)

由以上的例子可以看出,在其中一個張量的維度中,可以允許一個或多個維度的大小為 1。在大小為 1 的那個維度中,b (a) 的所有元素會被廣播到 a (b) 裡面同一個維度中所有的 index 上並執行加法運算。


2020年3月26日 星期四

PyTorch 中 weight 和 weight.data 的差異


當我們做完 backpropagation 得到 weight 和 bias 的 grad 之後,要進行 weight 和 bias 的更新時,有兩種不同的 coding style。

(1) 使用 torch.no_grad()
with torch.no_grad():
    weight -= learning_rate * weight.grad
    bias -= learning_rate * bias.grad

(2) 使用 weight.data 和 weight.grad.data
weight.data -= learning_rate * weight.grad.data
bias.data -= learning_rate * bias.grad.data

這兩種方法有何區別呢?根據 PyTorch 官方網站給的解釋:
Recall that tensor.data gives a tensor that shares the storage with tensor, but doesn't track history.
 tensor 和 tensor.data 共享同一個儲存空間,但是當我們使用 tensor.data 時,PyTorch 不會追蹤運算的歷史,也就是當我們進行 backward() 時,在 tensor.data 中不會進行 gradient 的計算。


Reference
https://pytorch.org/tutorials/beginner/examples_autograd/two_layer_net_autograd.html

PyTorch 的 nn 和 nn.functional 的差別


在 nn 裡面實現了很多搭建神經網路時常用的 building blocks 如 Conv2D、ReLu 等等。但是相同的名稱在 nn.functional 裡面也能找到,那它們之間有何差別?

差別在於 nn 裡面的 building blocks 是用 Python 的 Class 來實現的,他繼承了nn.Module 這個 Class,像 weight 和 bias 等 variable 會存在 nn.Conv2D 裡面。但是對於 nn.functional.Conv2D 來說,因為它只是一個 function 而不是 class,function 本身是沒有狀態的 (state),所有一切 variable 在 function 結束以後就消失了,因此它的 weight 和 bias 等需要保留的 variable 就必須從外面傳入。

這也是為什麼,當我們創建一個 network 時,nn.Conv2D 要寫在 self.__init__ 裡面,但是 nn.functional.relu 卻不用。


Reference
https://discuss.pytorch.org/t/what-is-the-difference-between-torch-nn-and-torch-nn-functional/33597

2020年3月25日 星期三

PyTorch 的 backward function


在呼叫 t.backward() 時,若 t 是一個純量,就不需要傳入任何的引數。但是當 t 是一個張量的時候,就需要傳入一個和 t 同樣 size 的張量,這個張量是做什麼用的?

假設我們的 t = [t1, t2],這個張量的運算圖裡面有一個 leaf node 是 x = [x1, x2]。如果在呼叫 backward 時,我們傳入 [1, 1],PyTorch 會將 t 當中的每一個元素 (t1 和 t2) 都對 x1 進行偏微分,並且將所有的結果加起來得到 x.grad = [g1, g2] 中的 g1。

此時如果我們只想要知道 t1 對 x1 的偏微分結果,就要在呼叫 backward 時,傳入引數 [1, 0]。

這個傳入的引數,可以看成一個權重,可以控制 t 裡面每一個元素對偏微分的影響程度。在針對一個運算圖進行 backward 時,每一個 operation 的 backward function 會接收它的下游所傳來的 gradient,因為在進行 back propagation 時,上游的 gradient 是透過微分的鏈鎖律 (chain rule) 算出來的,也就是 backward function 的 input 會和該 operation 的 gradient 相乘,去得到上游的 gradient。


Reference
Sherlock, "PyTorch中的backward," https://zhuanlan.zhihu.com/p/27808095.

2020年2月4日 星期二

神經型態運算架構


SpiNNaker
Affiliation: University of Manchester, UK
Architecture: ARM processor-based
Neuron: LIF, Izhikevich
On-Chip Learning: STDP
Platform: PyNN
Reference: Furber, S. B., Galluppi, F., Temple, S., & Plana, L. A. (2014). The spinnaker project. Proceedings of the IEEE, 102(5), 652-665.

TrueNorth
Affiliation: IBM, USA
Architecture: digital ASIC
Neuron: LIF
On-Chip Learning: N/A
Reference:
[1] Merolla, P. A., Arthur, J. V., Alvarez-Icaza, R., Cassidy, A. S., Sawada, J., Akopyan, F., ... & Brezzo, B. (2014). A million spiking-neuron integrated circuit with a scalable communication network and interface. Science, 345(6197), 668-673.
[2] Esser, S. K., Merolla, P. A., Arthur, J. V., Cassidy, A. S., Appuswamy, R., Andreopoulos, A., ... & Barch, D. R. (2016). Convolutional networks for fast, energy-efficient neuromorphic computing. 2016. Preprint on ArXiv. http://arxiv. org/abs/1603.08270. Accessed, 27.

Loihi
Affiliation: Intel, USA
Architecture: digital ASIC
On-Chip Learning: pairwise STDP, triplet STDP, reinforcement learning
Platform: Nengo
Reference: Davies, M., Srinivasa, N., Lin, T. H., Chinya, G., Cao, Y., Choday, S. H., ... & Liao, Y. (2018). Loihi: A neuromorphic manycore processor with on-chip learning. IEEE Micro, 38(1), 82-99.

BrainScaleS/HiCANN
Affiliation: Heidelberg University, Germany
Architecture: mixed-signal (analog neuron and digital communication) wafer-scale system
Neuron: adaptive exponential IF
On-Chip Learning: highly flexible learning rules
Platform: PyNN
Reference:
[1] Meier, K. (2015, December). A mixed-signal universal neuromorphic computing system. In 2015 IEEE International Electron Devices Meeting (IEDM) (pp. 4-6). IEEE.
[2] Schemmel, J., Briiderle, D., Griibl, A., Hock, M., Meier, K., & Millner, S. (2010, May). A wafer-scale neuromorphic hardware system for large-scale neural modeling. In Proceedings of 2010 IEEE International Symposium on Circuits and Systems (pp. 1947-1950). IEEE.
[3] Friedmann, S., Schemmel, J., Grübl, A., Hartel, A., Hock, M., & Meier, K. (2016). Demonstrating hybrid learning in a flexible neuromorphic hardware system. IEEE transactions on biomedical circuits and systems, 11(1), 128-142.

NeuroGrid/BrainDrop
Affiliation: Stanford University, USA
Architecture: mixed-signal ASIC
Reference: Benjamin, B. V., Gao, P., McQuinn, E., Choudhary, S., Chandrasekaran, A. R., Bussat, J. M., ... & Boahen, K. (2014). Neurogrid: A mixed-analog-digital multichip system for large-scale neural simulations. Proceedings of the IEEE, 102(5), 699-716.

DYNAP
Affiliation: Institute of Neuroinformatics (INI), University of Zurich and ETH Zurich
Architecture: mixed-signal ASIC (ultralow-power subthreshold analog neuron, digital circuit for reprogramming of connectivity, supporting for RNN and multilayer network)
Reference: Moradi, S., Qiao, N., Stefanini, F., & Indiveri, G. (2017). A scalable multicore architecture with heterogeneous memory structures for dynamic neuromorphic asynchronous processors (DYNAPs). IEEE transactions on biomedical circuits and systems, 12(1), 106-122.

ODIN
Affiliation: Catholic University Louvain, Belgium
Architecture: digital ASIC
Neuron: LIF, Izhikevich
On-Chip Learning: spike-driven plasticity
Reference: Frenkel, C., Lefebvre, M., Legat, J. D., & Bol, D. (2018). A 0.086-mm $^ 2 $12.7-pJ/SOP 64k-synapse 256-neuron online-learning digital spiking neuromorphic processor in 28-nm CMOS. IEEE transactions on biomedical circuits and systems, 13(1), 145-158.

Reference
Rajendran, B., Sebastian, A., Schmuker, M., Srinivasa, N., & Eleftheriou, E. (2019). Low-Power Neuromorphic Hardware for Signal Processing Applications: A review of architectural and system-level design approaches. IEEE Signal Processing Magazine, 36(6), 97-110.